Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klra1P20937 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Klra1P20937 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klra1P20937 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klra1P20937 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klra1P20937 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klra1P20937 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klra1P20937 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klra1P20937 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klra1P20937 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klra1P20937 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klra1P20937 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Klra1P20937 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klra1P20937 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms