Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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