Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ntf3P20181 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms