Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VimP20152 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VimP20152 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VimP20152 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VimP20152 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VimP20152 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VimP20152 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VimP20152 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VimP20152 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VimP20152 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VimP20152 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VimP20152 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VimP20152 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VimP20152 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VimP20152 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VimP20152 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VimP20152 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VimP20152 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VimP20152 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VimP20152 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VimP20152 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VimP20152 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VimP20152 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VimP20152 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VimP20152 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VimP20152 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VimP20152 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VimP20152 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VimP20152 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VimP20152 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VimP20152 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VimP20152 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VimP20152 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VimP20152 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VimP20152 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VimP20152 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VimP20152 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VimP20152 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VimP20152 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VimP20152 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VimP20152 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VimP20152 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VimP20152 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VimP20152 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VimP20152 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VimP20152 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VimP20152 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VimP20152 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VimP20152 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VimP20152 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VimP20152 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VimP20152 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VimP20152 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VimP20152 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VimP20152 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VimP20152 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VimP20152 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VimP20152 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VimP20152 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VimP20152 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VimP20152 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VimP20152 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VimP20152 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VimP20152 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VimP20152 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VimP20152 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VimP20152 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VimP20152 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VimP20152 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VimP20152 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VimP20152 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VimP20152 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VimP20152 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VimP20152 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VimP20152 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VimP20152 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VimP20152 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VimP20152 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VimP20152 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VimP20152 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VimP20152 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VimP20152 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VimP20152 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VimP20152 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VimP20152 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VimP20152 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VimP20152 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms