Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P20040 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
P20040 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P20040 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P20040 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P20040 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P20040 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P20040 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
P20040 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
P20040 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P20040 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P20040 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P20040 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P20040 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P20040 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
P20040 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
P20040 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P20040 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P20040 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P20040 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P20040 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P20040 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P20040 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P20040 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P20040 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P20040 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P20040 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P20040 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P20040 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P20040 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P20040 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P20040 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P20040 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P20040 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P20040 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P20040 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P20040 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P20040 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P20040 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P20040 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P20040 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
P20040 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P20040 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
P20040 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P20040 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P20040 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P20040 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P20040 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P20040 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P20040 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P20040 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P20040 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P20040 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P20040 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P20040 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P20040 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P20040 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P20040 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P20040 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P20040 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P20040 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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