Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PdgfaP20033 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PdgfaP20033 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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