Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms