Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnc1P19123 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms