Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms