Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmga1P17095 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms