Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rag1P15919 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rag1P15919 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rag1P15919 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rag1P15919 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rag1P15919 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rag1P15919 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rag1P15919 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rag1P15919 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms