Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RhoP15409 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RhoP15409 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhoP15409 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhoP15409 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhoP15409 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhoP15409 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhoP15409 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhoP15409 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhoP15409 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhoP15409 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhoP15409 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhoP15409 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhoP15409 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhoP15409 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RhoP15409 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhoP15409 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhoP15409 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhoP15409 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhoP15409 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhoP15409 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhoP15409 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhoP15409 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhoP15409 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhoP15409 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RhoP15409 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RhoP15409 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RhoP15409 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RhoP15409 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RhoP15409 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RhoP15409 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RhoP15409 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RhoP15409 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RhoP15409 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RhoP15409 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RhoP15409 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RhoP15409 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RhoP15409 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RhoP15409 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RhoP15409 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RhoP15409 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RhoP15409 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RhoP15409 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RhoP15409 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RhoP15409 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RhoP15409 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RhoP15409 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms