Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrgnP13609 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrgnP13609 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms