Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms