Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb1P12658 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb1P12658 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb1P12658 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb1P12658 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms