Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms