Protein–RNA interactions for Protein: P11983

Tcp1, T-complex protein 1 subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp1P11983 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcp1P11983 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcp1P11983 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms