Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt8P11679 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt8P11679 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt8P11679 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt8P11679 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt8P11679 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt8P11679 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt8P11679 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt8P11679 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt8P11679 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt8P11679 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt8P11679 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt8P11679 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt8P11679 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms