Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxb4P10284 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms