Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myod1P10085 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms