Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms