Protein–RNA interactions for Protein: P0DP27

Calm2, Calmodulin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm2P0DP27 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms