Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Becn2P0DM65 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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