Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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PtprqP0C5E4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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PtprqP0C5E4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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PtprqP0C5E4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprqP0C5E4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms