Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Surf1P09925 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Surf1P09925 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms