Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NclP09405 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NclP09405 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NclP09405 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NclP09405 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NclP09405 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NclP09405 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NclP09405 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NclP09405 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NclP09405 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NclP09405 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NclP09405 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NclP09405 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NclP09405 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NclP09405 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NclP09405 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NclP09405 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NclP09405 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NclP09405 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NclP09405 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NclP09405 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NclP09405 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NclP09405 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NclP09405 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NclP09405 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NclP09405 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NclP09405 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NclP09405 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NclP09405 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NclP09405 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NclP09405 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NclP09405 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NclP09405 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NclP09405 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NclP09405 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NclP09405 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NclP09405 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NclP09405 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NclP09405 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NclP09405 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NclP09405 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NclP09405 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NclP09405 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NclP09405 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NclP09405 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NclP09405 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NclP09405 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NclP09405 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NclP09405 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NclP09405 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NclP09405 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NclP09405 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NclP09405 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NclP09405 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NclP09405 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NclP09405 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NclP09405 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NclP09405 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NclP09405 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NclP09405 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NclP09405 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NclP09405 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NclP09405 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NclP09405 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NclP09405 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NclP09405 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NclP09405 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NclP09405 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NclP09405 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NclP09405 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NclP09405 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NclP09405 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NclP09405 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NclP09405 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NclP09405 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NclP09405 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NclP09405 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NclP09405 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NclP09405 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NclP09405 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NclP09405 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NclP09405 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NclP09405 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NclP09405 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NclP09405 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NclP09405 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NclP09405 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NclP09405 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NclP09405 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NclP09405 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NclP09405 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NclP09405 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NclP09405 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NclP09405 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NclP09405 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NclP09405 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NclP09405 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NclP09405 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NclP09405 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NclP09405 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms