Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms