Protein–RNA interactions for Protein: P06837

Gap43, Neuromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gap43P06837 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gap43P06837 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gap43P06837 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gap43P06837 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gap43P06837 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gap43P06837 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gap43P06837 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gap43P06837 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms