Protein–RNA interactions for Protein: P06329

Ig heavy chain V region AC38 15.3, mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06329 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P06329 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06329 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06329 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06329 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06329 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06329 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06329 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P06329 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P06329 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06329 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06329 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06329 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06329 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06329 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06329 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06329 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P06329 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06329 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06329 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06329 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06329 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06329 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06329 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06329 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06329 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06329 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06329 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06329 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06329 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06329 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06329 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06329 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06329 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06329 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06329 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06329 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06329 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06329 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06329 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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