Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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H2-Eb1P04230 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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