Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tgfb1P04202 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms