Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tk1P04184 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tk1P04184 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tk1P04184 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tk1P04184 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tk1P04184 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tk1P04184 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tk1P04184 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tk1P04184 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tk1P04184 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk1P04184 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk1P04184 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tk1P04184 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms