Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa7P02830 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hoxa7P02830 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hoxa7P02830 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hoxa7P02830 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa7P02830 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa7P02830 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa7P02830 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa7P02830 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa7P02830 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa7P02830 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa7P02830 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa7P02830 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa7P02830 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa7P02830 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa7P02830 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa7P02830 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa7P02830 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa7P02830 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa7P02830 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa7P02830 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa7P02830 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa7P02830 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa7P02830 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa7P02830 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms