Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53P02340 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53P02340 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53P02340 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53P02340 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53P02340 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53P02340 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53P02340 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms