Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sypl2O89104 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms