Protein–RNA interactions for Protein: O88875

Cd160, CD160 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd160O88875 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd160O88875 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms