Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10509O88255 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms