Protein–RNA interactions for Protein: O88174

Cd46, Membrane cofactor protein, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd46O88174 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd46O88174 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd46O88174 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd46O88174 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Cd46O88174 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cd46O88174 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cd46O88174 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd46O88174 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd46O88174 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd46O88174 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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