Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Psma3O70435 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psma3O70435 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psma3O70435 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psma3O70435 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psma3O70435 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psma3O70435 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psma3O70435 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psma3O70435 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psma3O70435 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Psma3O70435 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma3O70435 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Psma3O70435 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma3O70435 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psma3O70435 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psma3O70435 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma3O70435 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma3O70435 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma3O70435 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Psma3O70435 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma3O70435 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma3O70435 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psma3O70435 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma3O70435 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psma3O70435 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Psma3O70435 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma3O70435 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma3O70435 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma3O70435 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma3O70435 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma3O70435 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma3O70435 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma3O70435 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma3O70435 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma3O70435 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma3O70435 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma3O70435 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma3O70435 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma3O70435 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma3O70435 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma3O70435 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psma3O70435 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psma3O70435 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma3O70435 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma3O70435 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma3O70435 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Psma3O70435 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Psma3O70435 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma3O70435 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psma3O70435 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psma3O70435 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma3O70435 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma3O70435 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma3O70435 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma3O70435 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma3O70435 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma3O70435 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Psma3O70435 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma3O70435 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma3O70435 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psma3O70435 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma3O70435 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma3O70435 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psma3O70435 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma3O70435 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma3O70435 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psma3O70435 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma3O70435 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms