Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Xirp1O70373 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms