Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Chrna4O70174 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chrna4O70174 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Chrna4O70174 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chrna4O70174 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna4O70174 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chrna4O70174 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chrna4O70174 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna4O70174 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna4O70174 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chrna4O70174 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna4O70174 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna4O70174 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna4O70174 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna4O70174 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna4O70174 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna4O70174 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna4O70174 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna4O70174 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna4O70174 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna4O70174 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna4O70174 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna4O70174 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna4O70174 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna4O70174 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna4O70174 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chrna4O70174 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna4O70174 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chrna4O70174 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chrna4O70174 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna4O70174 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna4O70174 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna4O70174 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna4O70174 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna4O70174 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna4O70174 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna4O70174 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna4O70174 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna4O70174 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna4O70174 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna4O70174 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna4O70174 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna4O70174 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna4O70174 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna4O70174 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna4O70174 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chrna4O70174 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna4O70174 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna4O70174 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna4O70174 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna4O70174 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna4O70174 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chrna4O70174 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chrna4O70174 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna4O70174 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chrna4O70174 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chrna4O70174 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna4O70174 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna4O70174 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna4O70174 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna4O70174 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna4O70174 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna4O70174 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna4O70174 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna4O70174 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna4O70174 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna4O70174 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna4O70174 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna4O70174 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna4O70174 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna4O70174 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna4O70174 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Chrna4O70174 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Chrna4O70174 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chrna4O70174 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chrna4O70174 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chrna4O70174 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chrna4O70174 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chrna4O70174 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Chrna4O70174 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chrna4O70174 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chrna4O70174 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chrna4O70174 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chrna4O70174 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chrna4O70174 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Chrna4O70174 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chrna4O70174 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Chrna4O70174 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Chrna4O70174 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Chrna4O70174 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Chrna4O70174 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Chrna4O70174 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Chrna4O70174 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Chrna4O70174 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chrna4O70174 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chrna4O70174 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chrna4O70174 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chrna4O70174 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chrna4O70174 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chrna4O70174 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms