Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkbO70126 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AurkbO70126 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms