Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlkO54988 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlkO54988 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlkO54988 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlkO54988 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlkO54988 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlkO54988 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlkO54988 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlkO54988 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlkO54988 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlkO54988 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlkO54988 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SlkO54988 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SlkO54988 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SlkO54988 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SlkO54988 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SlkO54988 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SlkO54988 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SlkO54988 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SlkO54988 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SlkO54988 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SlkO54988 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SlkO54988 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SlkO54988 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SlkO54988 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SlkO54988 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SlkO54988 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SlkO54988 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SlkO54988 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SlkO54988 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SlkO54988 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SlkO54988 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SlkO54988 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SlkO54988 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SlkO54988 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SlkO54988 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SlkO54988 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SlkO54988 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SlkO54988 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SlkO54988 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SlkO54988 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SlkO54988 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SlkO54988 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SlkO54988 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SlkO54988 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SlkO54988 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SlkO54988 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SlkO54988 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SlkO54988 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlkO54988 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlkO54988 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlkO54988 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlkO54988 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlkO54988 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlkO54988 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlkO54988 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlkO54988 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SlkO54988 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlkO54988 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlkO54988 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlkO54988 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlkO54988 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlkO54988 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlkO54988 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlkO54988 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlkO54988 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlkO54988 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlkO54988 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlkO54988 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlkO54988 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlkO54988 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlkO54988 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlkO54988 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlkO54988 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlkO54988 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SlkO54988 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlkO54988 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlkO54988 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SlkO54988 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlkO54988 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlkO54988 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlkO54988 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SlkO54988 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SlkO54988 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlkO54988 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SlkO54988 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlkO54988 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlkO54988 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlkO54988 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlkO54988 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlkO54988 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlkO54988 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlkO54988 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlkO54988 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlkO54988 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlkO54988 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlkO54988 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlkO54988 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlkO54988 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlkO54988 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms