Protein–RNA interactions for Protein: O54851

Gjd2, Gap junction delta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd2O54851 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gjd2O54851 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjd2O54851 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.7 ms