Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
ChkaO54804 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ChkaO54804 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ChkaO54804 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChkaO54804 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ChkaO54804 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChkaO54804 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChkaO54804 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ChkaO54804 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChkaO54804 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChkaO54804 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ChkaO54804 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChkaO54804 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChkaO54804 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChkaO54804 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChkaO54804 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChkaO54804 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChkaO54804 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChkaO54804 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChkaO54804 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChkaO54804 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChkaO54804 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChkaO54804 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChkaO54804 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChkaO54804 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ChkaO54804 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChkaO54804 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChkaO54804 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ChkaO54804 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChkaO54804 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChkaO54804 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChkaO54804 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChkaO54804 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChkaO54804 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChkaO54804 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChkaO54804 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChkaO54804 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ChkaO54804 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChkaO54804 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChkaO54804 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChkaO54804 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChkaO54804 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChkaO54804 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChkaO54804 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChkaO54804 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChkaO54804 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChkaO54804 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChkaO54804 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChkaO54804 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ChkaO54804 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChkaO54804 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ChkaO54804 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ChkaO54804 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChkaO54804 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChkaO54804 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ChkaO54804 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ChkaO54804 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChkaO54804 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChkaO54804 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ChkaO54804 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChkaO54804 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChkaO54804 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChkaO54804 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChkaO54804 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChkaO54804 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChkaO54804 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChkaO54804 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChkaO54804 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChkaO54804 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChkaO54804 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ChkaO54804 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChkaO54804 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ChkaO54804 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ChkaO54804 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ChkaO54804 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ChkaO54804 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ChkaO54804 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ChkaO54804 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ChkaO54804 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ChkaO54804 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ChkaO54804 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ChkaO54804 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ChkaO54804 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChkaO54804 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChkaO54804 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChkaO54804 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ChkaO54804 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ChkaO54804 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChkaO54804 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChkaO54804 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChkaO54804 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ChkaO54804 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ChkaO54804 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChkaO54804 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ChkaO54804 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChkaO54804 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChkaO54804 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChkaO54804 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChkaO54804 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChkaO54804 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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