Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffaO54786 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffaO54786 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffaO54786 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DffaO54786 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DffaO54786 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DffaO54786 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffaO54786 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffaO54786 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffaO54786 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffaO54786 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffaO54786 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffaO54786 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffaO54786 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffaO54786 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DffaO54786 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffaO54786 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffaO54786 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffaO54786 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffaO54786 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffaO54786 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffaO54786 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffaO54786 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffaO54786 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffaO54786 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffaO54786 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffaO54786 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DffaO54786 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffaO54786 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffaO54786 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DffaO54786 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffaO54786 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffaO54786 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffaO54786 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffaO54786 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffaO54786 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffaO54786 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffaO54786 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffaO54786 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffaO54786 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffaO54786 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffaO54786 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffaO54786 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffaO54786 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffaO54786 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffaO54786 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffaO54786 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffaO54786 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DffaO54786 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffaO54786 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffaO54786 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffaO54786 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffaO54786 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffaO54786 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffaO54786 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffaO54786 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffaO54786 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DffaO54786 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DffaO54786 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DffaO54786 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DffaO54786 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffaO54786 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffaO54786 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffaO54786 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffaO54786 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffaO54786 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffaO54786 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffaO54786 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffaO54786 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffaO54786 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffaO54786 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffaO54786 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffaO54786 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DffaO54786 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DffaO54786 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DffaO54786 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DffaO54786 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DffaO54786 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DffaO54786 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DffaO54786 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DffaO54786 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DffaO54786 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DffaO54786 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DffaO54786 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DffaO54786 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DffaO54786 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DffaO54786 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DffaO54786 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DffaO54786 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DffaO54786 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DffaO54786 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DffaO54786 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DffaO54786 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffaO54786 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffaO54786 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffaO54786 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffaO54786 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffaO54786 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffaO54786 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffaO54786 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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