Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc1O35914 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms