Protein–RNA interactions for Protein: O35902

Dsg3, Desmoglein-3, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg3O35902 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg3O35902 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms