Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf9O35739 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms