Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Opn1mwO35599 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms